Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E9PBE3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E9PBE3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E9PBE3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E9PBE3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E9PBE3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms