Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DXG7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
B4DXG7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
B4DXG7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
B4DXG7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4DXG7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DXG7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms