Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms