Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYSRT1A8MQ03 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.4 ms