Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA3AA6NCI4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms