Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms