Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM89A2RUT3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms