Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0D9SFI3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0D9SFI3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms