Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J248

TRAV1-1, T-cell receptor alpha variable 1-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV1-1A0A0B4J248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAV1-1A0A0B4J248 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms