Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms