Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SPC24Q8NBT2 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms