Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms