Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms