Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL354751.3-201ENST00000618526 1027 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC024257.4-201ENST00000618746 458 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PXYLP1-204ENST00000504264 1773 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 GFRAL-201ENST00000340465 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LRRC4C-201ENST00000278198 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PCDHGA5-202ENST00000611914 3552 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 DEPDC5-202ENST00000382112 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AASS-202ENST00000393376 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP003716.1-202ENST00000511677 3387 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC024610.2-204ENST00000637478 2867 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FANCB-202ENST00000398334 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TMPPE-201ENST00000342462 3962 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MYOM2-212ENST00000523438 3328 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CEP70-210ENST00000481834 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SLC22A24-201ENST00000326192 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TRIM55-201ENST00000276573 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NPIPA7-202ENST00000530217 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CUBNP1-201ENST00000412710 1790 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CTAGE12P-201ENST00000400348 2364 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NIP7-202ENST00000254941 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC073263.1-202ENST00000401851 924 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 EGFLAM-207ENST00000506135 889 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC110768.2-201ENST00000506540 329 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC00958-203ENST00000527945 1121 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-206ENST00000550426 683 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-211ENST00000552990 654 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC073534.1-201ENST00000598671 1056 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 NUDT13-207ENST00000544879 2258 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC018682.1-201ENST00000506009 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC02260-201ENST00000508484 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC114689.1-201ENST00000578727 2484 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PSG8-204ENST00000406636 1610 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL627309.1-201ENST00000466430 2748 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MAOA-201ENST00000338702 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms