Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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EHD3Q9NZN3 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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