Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms