Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAB21L3-201ENST00000369500 3229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA1-203ENST00000448073 2825 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HACL1-201ENST00000321169 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-203ENST00000361569 2434 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NKAIN2-202ENST00000368417 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP1-202ENST00000338962 2169 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HBS1L-203ENST00000367822 2793 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS2-202ENST00000339750 3780 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104024.2-201ENST00000562897 3077 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA12-201ENST00000341228 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms