Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GTF3C6Q969F1 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms