Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
LAMA3Q16787 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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