Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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