Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms