Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
CNGB1Q14028 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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