Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KIAA1191-212ENST00000614420 2631 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MARCH8-202ENST00000395769 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KRT34-201ENST00000394001 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 VRK3-223ENST00000601341 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNE1B-203ENST00000622690 3149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OR11A1-204ENST00000641152 2440 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZSCAN31-209ENST00000439158 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ACTN3-201ENST00000502692 3084 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GAA-202ENST00000390015 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEMA3F-AS1-202ENST00000437204 2755 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC149-202ENST00000389609 2127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SCNN1B-201ENST00000307331 2085 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL513122.1-201ENST00000455437 1463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SERPINA10-202ENST00000393096 2451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ANKS1B-213ENST00000549025 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNA2-207ENST00000638532 2426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ANKRD20A3-201ENST00000611388 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BTBD16-201ENST00000260723 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SOX2OT_exon3.1-201ENST00000410534 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC097638.1-201ENST00000413663 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 LINC01006-203ENST00000425712 661 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PRAMEF32P-201ENST00000431596 1068 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC131235.1-201ENST00000433853 732 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AARSP1-201ENST00000514795 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP3-3Q9BYR6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms