Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SP6Q3SY56 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SP6Q3SY56 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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