Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NTRK2Q16620 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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