Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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