Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms