Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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