Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PAPPA2-201ENST00000367661 4369 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PGM2L1-201ENST00000298198 8515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RYR3Q15413 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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