Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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