Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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ITGA9Q13797 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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