Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TMPOP42166 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms