Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022182.3-201ENST00000529239 2167 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PROX2-201ENST00000556084 3359 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPT1P1-201ENST00000450418 2315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXL2NB-201ENST00000383165 3538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNE1-204ENST00000399289 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2D-202ENST00000367114 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP1-208ENST00000528443 3685 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH10-202ENST00000456609 3057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LTN1-203ENST00000389195 2714 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A8-201ENST00000368732 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DCTN3-204ENST00000378913 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PUDPP1-201ENST00000421058 495 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms