Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC025198.1-201ENST00000578331 419 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CCR3-201ENST00000357422 2000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RNA5SP209-201ENST00000411237 97 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 CA5B-204ENST00000454127 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
C4orf17Q53FE4 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.8 ms