Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
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