Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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NFIXQ14938 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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