Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TM4SF4P48230 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms