Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRHQ9HD43 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRHQ9HD43 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRHQ9HD43 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRHQ9HD43 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRHQ9HD43 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRHQ9HD43 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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