Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GTF2H3Q13889 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms