Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms