Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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