Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
FOXQ1Q9C009 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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