Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 TADA2A-202ENST00000612272 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 GOSR2-220ENST00000638838 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 SCMH1-211ENST00000456518 1586 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ZNF138-202ENST00000359735 2679 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 OR14K1-201ENST00000283225 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 TRBV10-1-201ENST00000390364 412 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC092100.1-203ENST00000421513 653 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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TREML4Q6UXN2 RN7SL507P-201ENST00000474076 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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TREML4Q6UXN2 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MIR3945HG-202ENST00000511703 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 WBP1LP2-201ENST00000515260 998 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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TREML4Q6UXN2 AC011767.1-203ENST00000559762 529 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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TREML4Q6UXN2 AL355987.5-201ENST00000621585 411 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 RBMS3-203ENST00000383767 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 FTO-217ENST00000637001 1609 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AKR1C3-201ENST00000380554 1807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LPXN-201ENST00000395074 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 DHRS9-206ENST00000436483 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 AOAH-211ENST00000617537 2381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TREML4Q6UXN2 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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