Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NR3C2-208ENST00000512865 3822 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 CD244-201ENST00000322302 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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KRTAP21-1Q3LI58 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RPL3P4-201ENST00000417615 423 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A1-AS1-203ENST00000418854 545 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 HCG21-204ENST00000419481 605 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-1Q3LI58 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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