Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PXYLP1-207ENST00000508812 4158 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MYEF2-216ENST00000616409 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FLNB-AS1-202ENST00000488720 3709 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CCR1-201ENST00000296140 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CU634019.1-201ENST00000623095 2247 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CU633904.1-202ENST00000625096 2247 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF169-201ENST00000340911 2336 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 KCNMA1-228ENST00000638223 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MAGEB16-201ENST00000399985 1667 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 DAZL-202ENST00000399444 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC00486-201ENST00000414054 1794 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 BARD1-213ENST00000619009 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RFX4-202ENST00000357881 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PFKFB1-202ENST00000375006 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 C11orf57-201ENST00000280352 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 H3F3AP6-201ENST00000230495 411 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 H3F3AP4-201ENST00000369387 411 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 FAM236D-201ENST00000419795 433 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 FAM236D-202ENST00000458170 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RN7SL359P-201ENST00000473502 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ITFG2-AS1-203ENST00000547794 442 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC010760.1-201ENST00000565129 545 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ULK4P3-202ENST00000565158 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 ZNF213-AS1-208ENST00000575139 530 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC087164.1-201ENST00000577847 513 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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MKRN4PQ13434 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PNLIPRP1-214ENST00000528052 1533 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PUS3-201ENST00000227474 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MCOLN2-202ENST00000370608 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ZNF709-201ENST00000397732 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SSX2-202ENST00000337502 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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