Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACACAQ13085 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACACAQ13085 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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