Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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