Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
GAPVD1Q14C86 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms