Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CDH18Q13634 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CDH18Q13634 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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