Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4BQ13620 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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